福建医科大学为福建省省属重点大学。前身是1926年5月创办于北京的私立东南医学院。1949年都江堰徽省，成为福建省第一所高等医科院校。1952 年改名为福建医学院。1996年6月经国家教委批准，更名为福建医科大学。学校位于福建省会福州市，校园环境优美，交通便利。学校将现代著名教育家蔡元培先生为学校前身东南医学院师生的题词“好学力行，造就良医”确立为校训，秉承“兴国、奉献、仁爱”的育人理念，倡导践行“求真、求精、求新”的校风学风。

学校拥有5所直属附属医院，6所非直属附属医院。学校坚持开放、合作、共赢的方针，与军事医学科学院、清华大学、中科院福州物质研究院、香港大学等建立战略合作伙伴关系，并在解放军上海军区总医院、空军总医院、海军总医院、武警总医院、解放军306医院、解放军307医院、新疆自治区人民医院等建立临床学院，目前临床学院达50余所，各专业实践教学基地100余所，分布于福建省各地市及上海、北京、河南、江西、湖北、山西、安徽、新疆等省市区。

学校拥有临床医学、药学2个博士学位授权一级学科点，共26个博士学位授权学科点，拥有临床医学博士专业学位授予权，有10个硕士学位授权一级学科点，74个硕士学位授权学科点。建立了药学、临床医学、公共卫生与预防医学3个博士后科研流动站。皮肤病与性病学为国家重点学科，中药药理学、中医肿瘤病学为国家中医药重点学科，有12个国家临床重点专科， 19个省级重点学科，42个省级临床医学重点学科和重点扶持学科；建有1个科技部省部共建国家重点实验室培育基地，2个教育部重点实验室、13个中央（财政部）与地方共建实验室，25个省级以上（重点）实验室（工程技术中心、科技公共服务平台、人文社科研究基地），是国家药品临床研究基地。

在职教职工3733人，博士生导师178人，硕士生导师1356人。在校生共1.9万人，其中研究生3160余人，留学生250余人。近5年来，学校共承担“863”、“973”计划、国家科技支撑计划和国家自然科学基金项目等420余项。国家自然科学基金立项数近年来保持福建省属高校领先地位。获国家科技进步二等奖一项、高校自然科学技术奖高等学校科学研究优秀成果奖（科学技术）一等奖一项、中华医学科技奖一等奖三项、中华医学科技奖医学科普奖和卫生管理奖各1项。学校成立了临床药理、皮肤病、卫生事业管理等65个省、校级研究所。